バナーが表示されないのは、"メンバーズステーション"に楽天会員資格でログインして確認している状況ということで良いでしょうか？（記憶があいまいですが、たしかSIM電話番号でログインしてもバナーが出なかった気がします。あと、メンバーズステーションとmy楽天モバイルを間違えている方が結構いらっしゃる気がしていますので、念のため確認です。）

メンバーズステーションのURLはこちらです。
https://members-station.mobile.rakuten.co.jp/members/rmb/login?language=J&campaign=web-rakuten&mno_migration=1

もし、"メンバーズステーション"に楽天会員資格でログインしているのであれば、状況から、過去に一度、楽天MVNOから楽天MNOに移行する申し込みを完了させている可能性が考えられます。その場合、申し込みを完了させたものの、実際にはMNOへの転入はせず放置しているか、MNOの申し込みをキャンセルしていることが考えられます。

my楽天モバイルにログインして申し込み履歴欄に申し込み履歴があれば、上記の仮説が当たっている可能性が高まります。
申し込み履歴の見方は、このヘルプを参考にしてください。
https://network.mobile.rakuten.co.jp/faq/detail/00001827/

仮説が当たっている場合ですが、コールセンターに問い合わせをしてシステム的な処理をしてもらわないと、楽天MVNOから楽天MNOへの転出転入ができません。（ショップに相談してどうにかなるかは不明ですが、コールセンターなら確実に処理できます。）

私の場合、あなたと同じくSIMカード入り案内が送られてきて、QRから移行しようとする→メンバーズステーションに移行リンクが表示されない→楽天アカウントからモバイルに入り申し込みをする→途中で進まなくなる→МNP予約番号を要求される→メンバーズステーションから発行する→入力する→それでも一切手続きが進まない←今ココNEW!!
です。
どうにもなりません。
で、今日丸一日使ってチャットサポートを受けようとするがAIにしか繋がらず、電話サポートを受けようとしても全く繋がらず、もうお手上げです。

答えになってなくてすみませんが、もう店舗に突撃した方が早いような気がしてます。