車のハンズフリーは通常の電話アプリに対応しています。Rakuten Linkはハンズフリーに対応していません。
下記の質問を参考にしてください。
https://community.mobile.rakuten.net/questions/d488st7kowauh7vw
なお、Linkアプリのバックグランド通信を禁止にしておけば、①Wi-Fi接続状態でない②Linkを起動していない の条件が満たされたとき通常の電話アプリに着信しますのでハンズフリーで電話に出られます。
ハンズフリー発信は通常の電話のみで、Link利用は無理です。