状況としては、「可能性②プロファイルを削除してしまった」がほぼ確定的です。
開通済みの状態でeSIMプロファイルを削除してしまうと、eSIM再発行申し込み時のSMS認証ができなくなります。

楽天モバイルの公式サポートに、「eSIMを削除してしまい、eSIM再発行時の2段階認証ができない。2段階認証を一時的に外して欲しい」とお願いしてください。

チャットでAIアシスタントの回答に「解決しなかった」とすると有人オペレーターに繋げられます。やり取りが何度も起きると時間が掛かるのて、なるべく一度でお願いが伝わるように努力してください。