よく調べられていますので、ほぼご認識通りで良いと思います。
通話は基本的にはRakuten Linkをお使いください。たまに「Android端末でもRakuten Linkではなく通常の電話アプリに着信した」と言う声がありますが、通信が安定していればRakuten Linkに着信するはずです。
もし通常の電話に着信があった場合は電話に出ないでRakuten Linkで折り返し電話をしてください。
ただし、フィリピン国内の電話番号へかける場合はRakuten Linkが68円/30秒、通常の電話アプリは75円/1分なので、30秒を超える電話発信には通常の電話がお得です。