私は買い替え超トクプログラムは使っていませんが、下記の案内以外の方法では買い替え超トクプログラムは適用されないと思います。

楽天モバイル買い替え超トクプログラム各種お手続き方法
機種変更方法（25カ月目以降）
https://network.mobile.rakuten.co.jp/guide/replacement-program/#anc02

新規購入できる製品が、買い替え超トクプログラムで「在庫なし」になる理由についてはサポートに聞いてみてください。あるいはショップに行けばスムーズに機種変更できるかもしれません。