アプリによって保存先が設定できる場合があります。例えばカメラアプリなら、設定項目の下記のところで選択できます。
他のアプリについても設定項目を探してみてください。本体ストレージ⇔SDカード間でファイルを手動で移動する場合は、GoogleのFilesアプリでできます。